Kyslíko-palivové spalování umožňuje zvýšením koncentrace CO2 ve spalinách snížit náklady na jeho zachycení. Ve spalinách však zůstávají přítomny běžné produkty spalování: vodní pára, kyslík, dusík (i když se sníženým podílem), argon a kyselé plyny, například SO3, SO2, HCl a NOx. Pro prevenci koroze a splnění pravděpodobných požadavků na sekvestraci bude třeba kyselé nečistoty před zavedením CO2 do potrubí z proudu CO2 odstranit. Mohou existovat i další přísné požadavky na čistotu, zejména u aplikací, jakými je například druhotná intenzifikace těžby ropy.